현재 네오 지온과 연방군, 지구연방군이 전쟁을 하는 중이다.

도마뱀 전쟁 이후 연방군과 지구연방군의 숨통이 트이자 이들은

네오 지온과 필사적인 전투를 하고 있다.

현재 네오 지온의 총수인 샤아 아즈나블은 돌파구를 찾는 중이며,

몇십년 전의 공룡제국과의 싸움에서 큰 공을 세웠으나

살인죄로 감금된 나가레 료마라는 사나이를, 주인공들은

지금 찾고 있는 것이다.